Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms