Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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