Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp43Q8BUM9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp43Q8BUM9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp43Q8BUM9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Usp43Q8BUM9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Usp43Q8BUM9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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