Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4aQ8BU40 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms