Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppfia2Q8BSS9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms