Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms