Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms