Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup107Q8BH74 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup107Q8BH74 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup107Q8BH74 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup107Q8BH74 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms