Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Atg4bQ8BGE6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Atg4bQ8BGE6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Atg4bQ8BGE6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Atg4bQ8BGE6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Atg4bQ8BGE6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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