Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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