Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms