Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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