Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ttc29Q80VM3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms