Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms