Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms