Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms