Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtn4rl2Q7M6Z0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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