Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trappc6aQ78XR0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trappc6aQ78XR0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trappc6aQ78XR0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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