Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms