Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cnot1Q6ZQ08 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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