Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms