Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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