Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms