Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms