Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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