Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arhgap20Q6IFT4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms