Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms