Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbf1Q6DFZ1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms