Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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