Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Sh3rf1Q69ZI1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3rf1Q69ZI1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3rf1Q69ZI1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Sh3rf1Q69ZI1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Sh3rf1Q69ZI1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3rf1Q69ZI1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Sh3rf1Q69ZI1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sh3rf1Q69ZI1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sh3rf1Q69ZI1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms