Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt12Q64291 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms