Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms