Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall3Q62255 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms