Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai1Q61818 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rai1Q61818 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rai1Q61818 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rai1Q61818 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rai1Q61818 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rai1Q61818 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai1Q61818 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai1Q61818 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai1Q61818 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai1Q61818 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai1Q61818 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai1Q61818 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai1Q61818 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rai1Q61818 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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