Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cd53Q61451 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cd53Q61451 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cd53Q61451 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cd53Q61451 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cd53Q61451 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cd53Q61451 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cd53Q61451 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cd53Q61451 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cd53Q61451 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cd53Q61451 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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