Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms