Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms