Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms