Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms