Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms