Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms