Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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