Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH62

Xkr9, XK-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr9Q5GH62 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xkr9Q5GH62 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms