Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms