Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms