Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pdp2Q504M2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pdp2Q504M2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pdp2Q504M2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pdp2Q504M2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pdp2Q504M2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pdp2Q504M2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pdp2Q504M2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pdp2Q504M2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pdp2Q504M2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pdp2Q504M2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pdp2Q504M2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdp2Q504M2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pdp2Q504M2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms