Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf38aQ4FK66 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf38aQ4FK66 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms