Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr7Q3V0I2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr7Q3V0I2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms