Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms