Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms